“作三界印”表示药师佛愿众生摆脱三界的迷惑，回到琉璃净土世界。佛教把世俗世界划分为欲界、色界、无色界三种：“欲界”为具有食欲、性欲的众生所有的境界，畜生、卵生、湿生（即爬虫类）等没能投胎为人的生灵也属这一界；“色界”为已经离开食、性二欲众生的境界，位于欲界之上，但是仍旧没有离开物欲；“无色界”为无欲无色众生的境界，已经彻悟世情，不再为世俗所累。要达到高一级的境界就要修行，依据佛教因果报应的说法，不修行来世生欲界，甚至不得为人生。尽管这三界层次各有高低，报应各不相同，但是没有脱离生死轮回的过程，药师佛作三界印要救度众生脱离轮回，达到涅槃的境界。
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愿所有弘法功德回向：
赞助、流通、见闻、随喜者，及皆悉回向尽法界、虚空界一切众生，依佛菩萨威德力、弘法功德力，普愿消除一切罪障，福慧具足，常得安乐，无诸病苦。欲行恶法，皆悉不成。所修善业，皆速成就。关闭一切诸恶趣门，开示人天涅槃正路。家门清吉，身心安康，先亡祖妣，历劫怨亲，俱蒙佛慈，获本妙心。兵戈永息，礼让兴行，人民安乐，天下太平。四恩总报，三有齐资，今生来世脱离一切外道天魔之缠缚，生生世世永离恶道，离一切苦得究竟乐，得遇佛菩萨、正法、清净善知识，临终无一切障碍而 往生有缘之佛净土，同证究竟圆满之佛果。
